يقع مسجد ماجوكي أتاري في مركز المدينة، إلى الغرب من مجمع ليابي-هاوز. في العصور الوسطى المبكرة، كان في هذا المكان سوق موخ (سوق القمر)، وبالقرب منه مركز عبادة مع معبد القمر. خلال الاحتفال بعيد النوروز في الربيع، كانت تُباع هنا التماثيل الصغيرة وصور الآلهة الشعبية. بعد أن استولى العرب على بخارى، أسسوا إحدى أولى المساجد في موقع معبد القمر. كشفت الحفريات داخل المسجد عن بقايا ديكور منحوت وأسس تعود إلى القرن العاشر. في عام 1930، تم اكتشاف البوابة الجنوبية للمسجد من القرن الثاني عشر تحت طبقة من التربة، مع زخارف فريدة من الطوب والماجوليكا المنحوتة. في العصور الوسطى المتأخرة، كان ماجوكي أتاري بمثابة مسجد الحي، حيث كان المدخل مواجهًا نحو ليابي-هاوز. (خميلنيتسكي س. 1992، ص. 80).